Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms