Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
APOBRQ0VD83 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBRQ0VD83 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBRQ0VD83 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBRQ0VD83 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBRQ0VD83 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBRQ0VD83 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBRQ0VD83 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBRQ0VD83 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBRQ0VD83 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBRQ0VD83 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBRQ0VD83 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBRQ0VD83 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms