Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms