Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms