Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms