Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms