Protein–RNA interactions for Protein: P84103

SRSF3, Serine/arginine-rich splicing factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF3P84103 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF3P84103 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms