Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMF1P82094 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMF1P82094 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMF1P82094 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMF1P82094 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMF1P82094 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMF1P82094 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMF1P82094 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMF1P82094 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMF1P82094 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMF1P82094 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMF1P82094 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMF1P82094 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMF1P82094 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMF1P82094 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMF1P82094 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMF1P82094 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms