Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HBBP68871 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
HBBP68871 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
HBBP68871 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
HBBP68871 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
HBBP68871 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
HBBP68871 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
HBBP68871 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
HBBP68871 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
HBBP68871 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
HBBP68871 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms