Protein–RNA interactions for Protein: P56645

PER3, Period circadian protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER3P56645 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PER3P56645 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PER3P56645 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PER3P56645 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PER3P56645 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PER3P56645 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PER3P56645 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PER3P56645 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PER3P56645 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PER3P56645 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PER3P56645 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PER3P56645 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PER3P56645 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PER3P56645 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PER3P56645 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PER3P56645 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PER3P56645 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PER3P56645 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PER3P56645 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms