Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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