Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPAP53621 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPAP53621 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms