Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms