Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSFMP43897 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSFMP43897 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms