Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIPAP38571 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIPAP38571 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms