Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFNP31947 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SFNP31947 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SFNP31947 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SFNP31947 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SFNP31947 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SFNP31947 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFNP31947 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SFNP31947 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFNP31947 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms