Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCAP28676 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCAP28676 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCAP28676 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCAP28676 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCAP28676 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCAP28676 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCAP28676 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms