Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms