Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms