Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF1BP20333 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF1BP20333 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF1BP20333 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF1BP20333 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF1BP20333 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms