Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms