Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms