Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP31

SH2D2A, SH2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D2AQ9NP31 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH2D2AQ9NP31 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms