Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms