Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms