Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms