Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms