Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.2 ms