Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms