Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms