Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST3Q8N1M1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms