Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP13Q86W25 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms