Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WSCD1Q658N2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WSCD1Q658N2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms