Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms