Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MSMPQ1L6U9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms