Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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GEN1Q17RS7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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