Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CTF1Q16619 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CTF1Q16619 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CTF1Q16619 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CTF1Q16619 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CTF1Q16619 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CTF1Q16619 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CTF1Q16619 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CTF1Q16619 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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CTF1Q16619 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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