Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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