Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOFQ13790 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOFQ13790 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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