Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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