Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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