Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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