Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLAMF1Q13291 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms