Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms