Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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