Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID5AQ03989 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms