Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms