Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms