Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms