Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms